RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	B3GALNT1	O75752	331 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PIAS2	O75928	621 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CYB5A	P00167	134 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF35	P13682	527 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PPP3CB	P16298	524 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf189	Q5VU69	101 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf88	Q6PI97	169 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TMUB2	Q71RG4	321 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ASB10	Q8WXI3	467 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK15	Q9H427	330 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		16.5	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		16.5	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	RNF4	P78317	190 aa		16.5	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		16.5	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	16.5	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		16.5	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		16.5	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	16.5	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	EDA	Q92838	391 aa		16.5	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559		H3BUI4	141 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF250	P15622	560 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CALCR	P30988	508 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CFHR1	Q03591	330 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	RAB12	Q6IQ22	244 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM82	A0PJX8	343 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A18	H0YCH9	400 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	LDLRAD4	O15165	306 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	DOK2	O60496	412 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MPZL1	O95297	269 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SIX6	O95475	246 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	GLB1	P16278	677 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	RAB6A	P20340	208 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MDGA2	Q7Z553	956 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ST7L	Q8TDW4	575 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CMKLR1	Q99788	373 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ARL6	Q9H0F7	186 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	POFUT1	Q9H488	388 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	FGF21	Q9NSA1	209 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		16.49	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TRIO	O75962	3097 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF208	O43345	1280 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DOB	P13765	273 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	DDIT4L	Q96D03	193 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK17	Q96T54	332 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM10	O14672	748 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CD74	P04233	296 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	AMY2A	P04746	511 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	OR4E1	P0C645	316 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MMP16	P51512	607 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PMPCA	Q10713	525 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	BAMBI	Q13145	260 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CTSF	Q9UBX1	484 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		16.48	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	H2BFM	P0C1H6	154 aa		16.47	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	RPA2	P15927	270 aa		16.47	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	GPR85	P60893	370 aa		16.47	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	HSF1	Q00613	529 aa		16.47	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	16.47	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TLE3	Q04726	772 aa		16.47	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SPOCK1	Q08629	439 aa		16.47	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MEF2D	Q14814	521 aa		16.47	■□□□□ 0.23

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