RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		3.91	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	NIN	Q8N4C6	2090 aa		3.91	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		3.9	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		3.9	□□□□□ -1.78
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087WV48	116 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0G2JMM0	328 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PPB8	328 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PQD3	144 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PRS3	328 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PINLYP	A6NC86	204 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PRR32	B1ATL7	298 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TP53I11	O14683	189 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CLOCK	O15516	846 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF264	O43296	627 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SCO2	O43819	266 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GMFG	O60234	142 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CEACAM4	O75871	244 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	LYPD3	O95274	346 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V1G2	O95670	118 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS1	P07477	247 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM18	P0DKX4	95 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ANPEP	P15144	967 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CNR1	P21554	472 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PRKACG	P22612	351 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FAS	P25445	335 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	HTR2A	P28223	471 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	LCN1	P31025	176 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	EVI2B	P34910	448 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEA2	P43356	314 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	DNASE1L1	P49184	302 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	IST1	P53990	364 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PSPH	P78330	225 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF117	Q03924	483 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SKP2	Q13309	424 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RCN1	Q15293	331 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR1Q1	Q15612	314 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR1C1	Q15619	314 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	NRF1	Q16656	503 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	LIN52	Q52LA3	116 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RTL4	Q6ZR62	310 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GPR119	Q8TDV5	335 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	HAS2	Q92819	552 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SLAMF9	Q96A28	289 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	SGK494	Q96LW2	274 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	AGAP4	Q96P64	663 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	UHRF2	Q96PU4	802 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	MCHR1	Q99705	422 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	HES7	Q9BYE0	225 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	LAT2	Q9GZY6	243 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	DSN1	Q9H410	356 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	ACER3	Q9NUN7	267 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	HPF1	Q9NWY4	346 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	VNN3	Q9NY84	501 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		U3KQV3	271 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	APC2	O95996	2303 aa		3.9	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087WYN8	130 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GWA3	101 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	OR5H15	A6NDH6	313 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
LINS1-210	ENST00000560934		H3BNH8	94 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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