RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 IFNW1P05000 195 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 COX5BP10606 129 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 EGR1P18146 543 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PRKCDQ05655 676 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PSG7Q13046 419 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 KLF10Q13118 480 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 CDK5R2Q13319 367 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 MTX3Q5HYI7 312 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NRMQ8IXM6 262 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 MICU2Q8IYU8 434 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SPICQ8N5J4 248 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PTP4A1Q93096 173 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 CMBLQ96DG6 245 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 SAMD8Q96LT4 415 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PRRC1Q96M27 445 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 COG8Q96MW5 612 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 GPA33Q99795 319 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 POLE4Q9NR33 117 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 RHCGQ9UBD6 479 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 AUP1Q9Y679 476 aa6.9□□□□□ -1.3
COCH-211ENST00000557065 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 GSTA4O15217 222 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 IGHV2-70P01814 119 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SLC9A3P48764 834 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 FOXL1Q12952 345 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 TRAM2Q15035 370 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 ZBED5Q49AG3 693 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 HAVCR1Q96D42 359 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 EMC7Q9NPA0 242 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SAR1AQ9NR31 198 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 IL19Q9UHD0 177 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 STARD10Q9Y365 291 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.89□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 A0A087WUU8 490 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 PRSS37A4D1T9 235 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 H7C1C5 153 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 J3KTA2 159 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 IFNL4K9M1U5 179 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 FFAR1O14842 300 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SGCEO43556 437 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 DOK2O60496 412 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SLC16A7O60669 478 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 ZNF682O95780 498 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 FSHBP01225 129 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SCG5P05408 212 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 CD14P08571 375 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 RAC2P15153 192 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 KITLGP21583 273 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 CPT2P23786 658 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 HTR5AP47898 357 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SLC6A9P48067 706 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 BTG1P62324 171 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 LCN6P62502 163 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 GUCY1A3Q02108 690 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 ZNF154Q13106 437 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 FHL1Q13642 323 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 IFI44LQ53G44 452 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 AWAT1Q58HT5 328 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SPRNQ5BIV9 151 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.88□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms