RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MAGIXQ9H6Y5 334 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PLAGL1Q9UM63 463 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 A4GNTQ9UNA3 340 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 FAM221AA4D161 298 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE10A6NGK3 116 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR5H14A6NHG9 310 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf105B2RV13 164 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 RGS11O94810 467 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 IL3P08700 152 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 APLNRP35414 380 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 XCR1P46094 333 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CD47Q08722 323 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR52E5Q8NH55 327 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR5R1Q8NH85 324 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR10J5Q8NHC4 309 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 M1APQ8TC57 530 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 DNASE2BQ8WZ79 361 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 EGLN2Q96KS0 407 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 EBPLQ9BY08 206 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 AK3Q9UIJ7 227 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 LOC730098B7Z3J9 87 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CCL22O00626 93 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2CO00762 179 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SPNP16150 400 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TCL1AP56279 114 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR12D2P58182 307 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KLRB1Q12918 225 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN31Q12999 210 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR6V1Q8N148 313 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CLDN19Q8N6F1 224 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 LFNGQ8NES3 379 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 FCAMRQ8WWV6 532 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 RTP4Q96DX8 246 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL15Q96M94 604 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 HARBI1Q96MB7 349 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF358Q9NW07 568 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CHRNA9Q9UGM1 479 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 NAGKQ9UJ70 344 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 MYH4Q9Y623 1939 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KCNAB3O43448 404 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ALOX12BO75342 701 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 RHBDL1O75783 438 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 STK17BO94768 372 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SOX14O95416 240 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CLIC3O95833 236 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 GABRA3P34903 492 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 BSGP35613 385 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R19P59542 299 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SHC2P98077 582 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 DOC2BQ14184 412 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ASCL4Q6XD76 172 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ZFAND4Q86XD8 727 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TIMD4Q96H15 378 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM19Q96HH6 336 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 GABRG3Q99928 467 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR2D2Q9H210 308 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OXSMQ9NWU1 459 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms