RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 NGFRP08138 427 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 KITLGP21583 273 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GIPRP48546 466 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PROX2Q3B8N5 592 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 NANPQ8TBE9 248 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PTP4A1Q93096 173 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 BEX2Q9BXY8 128 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 NKX2-8O15522 239 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 DIO1P49895 249 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PMPCAQ10713 525 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF681Q96N22 645 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 V9GY05 133 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ACP2P11117 423 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 MYF5P13349 255 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 EGLN2Q96KS0 407 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RAXQ9Y2V3 346 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ALG5Q9Y673 324 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PLXNB2O15031 1838 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PMS2P2O95744 297 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 TXNDC12O95881 172 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 MAS1P04201 325 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 THBS4P35443 961 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 KIR2DS2P43631 304 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CSN1S1P47710 185 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CXCR4P61073 352 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 EDDM3AQ14507 147 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 DUSP7Q16829 419 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GHITMQ9H3K2 345 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SPTA1P02549 2419 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PNR3 127 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 SLC35F4A4IF30 521 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 AQP7P3A6NL99 342 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 OR5H8P0DN80 308 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 NHLH1Q02575 133 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 PLA2G7Q13093 441 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 DYRK1AQ13627 763 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 ETFDHQ16134 617 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 IGFBP7Q16270 282 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 Q499Y3 187 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 PELI3Q8N2H9 469 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 MGLLQ99685 303 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 ETV7Q9Y603 341 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 SHOXO15266 292 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 TAPBPO15533 448 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 B4GALNT1Q00973 533 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 EGR3Q06889 387 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 ACKR1Q16570 336 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-209ENST00000550857 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 901.2 ms