RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SPRNQ5BIV9 151 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PIGTQ969N2 578 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 MOAP1Q96BY2 351 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 C14orf79Q96F83 325 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ZNF583Q96ND8 569 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GON7Q9BXV9 100 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 NME4O00746 187 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ARAFP10398 606 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CD8BP10966 210 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 COL8A2P25067 703 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 OR3A3P47888 321 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CRYBA2P53672 197 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 TTC23Q5W5X9 447 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GLYATQ6IB77 296 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ULK3Q6PHR2 472 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 BBS10Q8TAM1 723 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ABHD4Q8TB40 342 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 YIPF6Q96EC8 236 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 MUS81Q96NY9 551 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 NUP50Q9UKX7 468 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ZNF175Q9Y473 711 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 A0A087WZY1 265 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 RNF212BA8MTL3 300 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SHISA9B4DS77 424 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CDC42EP2O14613 210 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GPR171O14626 319 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SLC16A7O60669 478 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 APOA1P02647 267 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 HTR1AP08908 422 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SBK2P0C263 348 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PCMT1P22061 227 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PYCR1P32322 319 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 KDELR2P33947 212 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SERPINF1P36955 418 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GSK3BP49841 420 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DEFA1P59665 94 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DEFA3P59666 94 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DAG1Q14118 895 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 STEAP3Q658P3 488 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ZNF774Q6NX45 483 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 WDR31Q8NA23 367 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PIGXQ8TBF5 258 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FAM168AQ92567 244 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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CS-212ENST00000548567 PLK3Q9H4B4 646 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 MED20Q9H944 212 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FXYD1O00168 92 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 AGR2O95994 175 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CCDC159P0C7I6 412 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 THRBP10828 461 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 MAKP20794 623 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 HTR3AP46098 478 aa6.53□□□□□ -1.36
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CS-212ENST00000548567 RIN1Q13671 783 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 NDNFQ8TB73 568 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ZNF566Q969W8 418 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 MAP6Q96JE9 813 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FOXB1Q99853 325 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.53□□□□□ -1.36
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