RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAA4P35542 130 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTR5AP47898 357 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC7A5Q01650 507 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAPK11Q15759 364 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDONQ4KMG0 1287 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C17orf50Q8WW18 174 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TFAP2CQ92754 450 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF607Q96SK3 696 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDOQ99489 341 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB17Q9H0T7 212 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MKS1Q9NXB0 559 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBK1Q9UHD2 729 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GVI7 797 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF13O43567 381 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHST1O43916 411 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFPL1O95159 310 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC2A10O95528 541 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNW1P05000 195 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCHEP06276 602 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRNGP07510 517 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KITLGP21583 273 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTR2AP28223 471 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN8P56748 225 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJB13P59910 316 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAA20P61599 178 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POU4F2Q12837 409 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF220Q5VTB9 566 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCA5Q86VQ0 697 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGFRL1Q8N441 504 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST8SIA4Q92187 359 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBGCP3Q96CW5 907 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIAEQ9HAT2 523 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STARD10Q9Y365 291 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHG1P01857 330 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PROCP04070 461 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-DPB1P04440 258 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPA3P15088 417 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAHP16930 419 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GATA4P43694 442 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BMXP51813 675 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GUCY1A3Q02108 690 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8B8Q15620 311 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T2Q6IF00 324 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf107Q8IVU9 208 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf111Q8N326 155 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8J2Q8NGG1 315 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5J2Q8NH18 312 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAVCR1Q96D42 359 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RCHY1Q96PM5 261 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPYCQ99645 322 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FUT8Q9BYC5 575 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF702PQ9H963 129 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB18Q9NP72 206 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.29□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEGF11A6BM72 1044 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC154A6NI56 674 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DVL1O14640 695 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HDAC3O15379 428 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLNRO43193 412 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCN3O75636 299 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GYPAP02724 150 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCAP28676 217 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDKN2CP42773 168 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNG11P61952 73 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GUCA2AQ02747 115 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.2 ms