RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533730.5

CASP4-212, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CASP4, Length 1,214 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-212ENST00000533730 FFAR1O14842 300 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 CASKO14936 926 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 KRT33AO76009 404 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 KRT36O76013 467 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 OR7A10O76100 309 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 GADD45GO95257 159 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 ADORA3P0DMS8 318 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 FUT1P19526 365 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 COX5AP20674 150 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 SLC9A3P48764 834 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 UGT2B15P54855 530 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 VLDLRP98155 873 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 MS4A2Q01362 244 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 TGFBR3Q03167 851 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 PRKCDQ05655 676 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 LTBQ06643 244 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 FAM27E3Q08E93 113 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 FLOT2Q14254 428 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 KRT80Q6KB66 452 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 LINC00471Q8N535 108 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 MED18Q9BUE0 208 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 V9GYQ6 96 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 RELNP78509 3460 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 MS4A18H0YCH9 400 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 RNF13O43567 381 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 NR2C1P13056 603 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 IFI30P13284 250 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 PAX7P23759 505 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 FPR3P25089 353 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-212ENST00000533730 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 NIPAL3Q6P499 406 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 NRMQ8IXM6 262 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-212ENST00000533730 PFN4Q8NHR9 129 aa6.69□□□□□ -1.34
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