RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	GRK5	P34947	590 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	PPOX	P50336	477 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	UCP2	P55851	309 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	TEK	Q02763	1124 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	CRMP1	Q14194	572 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	MEP1B	Q16820	701 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	GJC3	Q8NFK1	279 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SNX33	Q8WV41	574 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SPG11	Q96JI7	2443 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ABCA4	P78363	2273 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059		M0R233	179 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	DCTN6	O00399	190 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	NDUFS7	O75251	213 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	MT-ND5	P03915	603 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	COX5B	P10606	129 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	GCH1	P30793	250 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	CARTPT	Q16568	116 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ABHD4	Q8TB40	342 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM64B	A6NI03	449 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059		H7C1Q1	480 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	RER1	O15258	196 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SYNGR3	O43761	229 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	HMGN1	P05114	100 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	GYPB	P06028	91 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	CSF3	P09919	207 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	FMO3	P31513	532 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	EVX1	P49640	407 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	EFNA4	P52798	201 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	BLVRA	P53004	296 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ACTR3	P61158	418 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	GINS1	Q14691	196 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	KCNMB1	Q16558	191 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	MOG	Q16653	247 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	MST1L	Q2TV78	715 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	C4orf45	Q96LM5	186 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	PITX2	Q99697	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	TPK1	Q9H3S4	243 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	NTN4	Q9HB63	628 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	OR6C6	A6NF89	314 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	TVP23A	A6NH52	213 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	FAM183A	A6NL82	134 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	DSCAM	O60469	2012 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ADRA2A	P08913	450 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SPARC	P09486	303 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SPI1	P17947	270 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ALDH3B1	P43353	468 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	SLC25A1	P53007	311 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	DSCR9	P59020	149 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CHID1-222	ENST00000533059	ERVS71-1	P61550	626 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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