RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514344.5

CHD1-211, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CHD1, Length 2,955 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1-211ENST00000514344 FAM159BA6NKW6 160 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 SEC14L6B5MCN3 397 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 LRRN3E7EW58 273 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 MS4A18H0YCH9 400 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 AIM2O14862 343 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 PAX4O43316 350 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 GSTA1P08263 222 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 GSTA2P09210 222 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 RBP1P09455 135 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 CDAP32320 146 aa2.6□□□□□ -1.99
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CHD1-211ENST00000514344 ACSM1Q08AH1 577 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 EPS8Q12929 822 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 MELKQ14680 651 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 KIAA0040Q15053 153 aa2.6□□□□□ -1.99
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CHD1-211ENST00000514344 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 MS4A18Q3C1V0 323 aa2.6□□□□□ -1.99
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CHD1-211ENST00000514344 ATAD3BQ5T9A4 648 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 LRFN4Q6PJG9 635 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 C6orf120Q7Z4R8 191 aa2.6□□□□□ -1.99
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CHD1-211ENST00000514344 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 ZBTB9Q96C00 473 aa2.6□□□□□ -1.99
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CHD1-211ENST00000514344 TMEM237Q96Q45 408 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 MID1IP1Q9NPA3 183 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 GLTPQ9NZD2 209 aa2.6□□□□□ -1.99
CHD1-211ENST00000514344 TP73O15350 636 aa2.59□□□□□ -1.99
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CHD1-211ENST00000514344 NPHS1O60500 1241 aa2.59□□□□□ -1.99
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CHD1-211ENST00000514344 PTGR1Q14914 329 aa2.59□□□□□ -2
CHD1-211ENST00000514344 SYPL1Q16563 259 aa2.59□□□□□ -2
CHD1-211ENST00000514344 ZNF678Q5SXM1 525 aa2.59□□□□□ -2
CHD1-211ENST00000514344 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.59□□□□□ -2
CHD1-211ENST00000514344 HHATQ5VTY9 493 aa2.59□□□□□ -2
CHD1-211ENST00000514344 RNF165Q6ZSG1 346 aa2.59□□□□□ -2
CHD1-211ENST00000514344 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.59□□□□□ -2
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