RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ZNF682O95780 498 aa14.3□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 SBK2P0C263 348 aa14.3□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 GPR4P46093 362 aa14.3□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 CDK5R2Q13319 367 aa14.3□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.3□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.3□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 Q96M85 177 aa14.3□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.3□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 GSTM3P21266 225 aa14.29□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 HTR5AP47898 357 aa14.29□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 IFI44LQ53G44 452 aa14.29□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 ARMCX1Q9P291 453 aa14.29□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.29□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.29□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 PRSS23O95084 383 aa14.28□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 FSHBP01225 129 aa14.28□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.28□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ZNF570Q96NI8 536 aa14.28□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.28□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ESM1Q9NQ30 184 aa14.28□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 MMP26Q9NRE1 261 aa14.28□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.28□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 STARD10Q9Y365 291 aa14.28□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 PPIAL4DF5H284 164 aa14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 GSTA4O15217 222 aa14.27□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.27□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A6Q92536 515 aa14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SAMD8Q96LT4 415 aa14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 RERGLQ9H628 205 aa14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 TENM1Q9UKZ4 2725 aa14.27□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 NME4O00746 187 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SERPINA1P01009 418 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ERFP50548 548 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A2P52569 658 aa14.26□□□□□ -0.13
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