RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 SLC22A1O15245 554 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 CCNKO75909 580 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 ANP32DO95626 131 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 MT-ATP6P00846 226 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 OAS1P00973 400 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 MBP02144 154 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 KRT8P05787 483 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 ANXA5P08758 320 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 CISD3P0C7P0 127 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 P0C879 139 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 THRBP10828 461 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 CYP2F1P24903 491 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 GDF1P27539 372 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 CD40LGP29965 261 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 CASP14P31944 242 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 RORAP35398 523 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 CES3Q6UWW8 571 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 PAGE2Q7Z2X7 111 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 PRSS42Q7Z5A4 293 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 AMZ2Q86W34 360 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 GPR137CQ8N3F9 429 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 C12orf29Q8N999 325 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 OR2L3Q8NG85 312 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 OR2T34Q8NGX1 318 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 P3H4Q92791 437 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 GLYATL1Q969I3 302 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 RASD2Q96D21 266 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 GON7Q9BXV9 100 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 PDFQ9HBH1 243 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 IL17CQ9P0M4 197 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-220ENST00000512069 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 A0A0J9YYE9 177 aa3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-220ENST00000512069 FAM228BP0C875 321 aa3.19□□□□□ -1.9
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