RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.14□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DRAM2Q6UX65 266 aa4.14□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF384Q8TF68 577 aa4.14□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHODLQ9H9P2 273 aa4.14□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.14□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HES2Q9Y543 173 aa4.14□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD300LBA8K4G0 201 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MT-ND4P03905 459 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OPN1SWP03999 348 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD1AP06126 327 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARAFP10398 606 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CPEP16870 476 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTCP1P56278 107 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RNF175Q8N4F7 328 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM19Q96HH6 336 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAB40CQ96S21 281 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RASL12Q9NYN1 266 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MEIS3P1A6NDR6 274 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GABRG2P18507 467 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SHC1P29353 583 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LGALS7P47929 136 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR10A3P58181 314 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ASB10Q8WXI3 467 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POM121L2Q96KW2 1035 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GNG8Q9UK08 70 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF732B4DXR9 585 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RFXAPO00287 272 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM150AQ86TG1 271 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LGI3Q8N145 548 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 THEM6Q8WUY1 208 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PITX2Q99697 317 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C5orf51A6NDU8 294 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RBP4P02753 201 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPX2P18283 190 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPL27P61353 136 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IER5LQ5T953 404 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC35G3Q8N808 338 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBTD1Q9HAC8 227 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDK1P06493 297 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAHD1Q6P587 224 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CSF3RQ99062 836 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GABRG3Q99928 467 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A1W2PP55 124 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAPNS1P04632 268 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AMY2BP19961 511 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BCKDHBP21953 392 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBE2G1P62253 170 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCNAB2Q13303 367 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ST3GAL2Q16842 350 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TEX261Q6UWH6 196 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CTRCQ99895 268 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MS4A8Q9BY19 250 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 U3KQ87 197 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HLCSP50747 726 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEMA3BQ13214 749 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR4A16Q8NH70 328 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PIGTQ969N2 578 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARSGQ96EG1 525 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRFN1Q9P244 771 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OPN4Q9UHM6 478 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAB27BO00194 218 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KNG1P01042 644 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COX5AP20674 150 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBXA2RP21731 343 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CARD18P57730 90 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR4A47Q6IF82 309 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNRF4Q8WWF5 429 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A1B0GTQ1 180 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms