RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 SLC43A1O75387 559 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SERPINI2O75830 405 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SNAP29O95721 258 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 BAG2O95816 211 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 YES1P07947 543 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NR2C1P13056 603 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CTLA4P16410 223 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IGFBP2P18065 325 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 EGR1P18146 543 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GABRB1P18505 474 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC2A5P22732 501 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CHRNB4P30926 498 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GGT2P36268 569 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CSNK1A1P48729 337 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GZMKP49863 264 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ASCL1P50553 236 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RPS6KA3P51812 740 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ARHGDIAP52565 204 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SMSP52788 366 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CRISP1P54107 249 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RAD23AP54725 363 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 BIDP55957 195 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CLDN17P56750 224 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RAP1BP61224 184 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 LCN6P62502 163 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RAP1AP62834 184 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SORDQ00796 357 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 FMODQ06828 376 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 LGALS3BPQ08380 585 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GTF3C1Q12789 2109 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NPRL3Q12980 569 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 KEAP1Q14145 624 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CRMP1Q14194 572 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GGTLC2Q14390 218 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 HSPB2Q16082 182 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF691Q5VV52 312 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM211Q6ICI0 200 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NIPAL3Q6P499 406 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 IZUMO2Q6UXV1 221 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 Q6ZSN1 163 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 Q6ZT83 130 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 USP51Q70EK9 711 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF627Q7L945 461 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RRM2BQ7LG56 351 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GPAT4Q86UL3 456 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 FJX1Q86VR8 437 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 CDK20Q8IZL9 346 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 KDM8Q8N371 416 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 C10orf53Q8N6V4 93 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RND1Q92730 232 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM54Q969K7 222 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NABP1Q96AH0 204 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 STARD4Q96DR4 205 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 LRRC46Q96FV0 321 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 LRR1Q96L50 414 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 Q96M85 177 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 DDOQ99489 341 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 EMC6Q9BV81 110 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 OR10A4Q9H209 315 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 VCXQ9H320 206 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 PIGMQ9H3S5 423 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 FN3KQ9H479 309 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 TOR3AQ9H497 397 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 RIBC2Q9H4K1 309 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-212ENST00000498694 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms