RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496332.5

THBS3-208, Transcript of thrombospondin 3, human

TSL 3

Gene THBS3, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THBS3-208	ENST00000496332	DOK2	O60496	412 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ICMT	O60725	284 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	CDC14B	O60729	498 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	FAM107A	O95990	144 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	IFNA2	P01563	188 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	COX5B	P10606	129 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ATP6V1B2	P21281	511 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	IGFBP5	P24593	272 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	FPR3	P25089	353 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	SLC6A6	P31641	620 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	IFNGR2	P38484	337 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	HTR5A	P47898	357 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ARHGDIA	P52565	204 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	TMEM33	P57088	247 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	PPP1CB	P62140	327 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ARL9	Q6T311	187 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	OR52D1	Q9H346	318 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	DYNC1I1	O14576	645 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	RP2	O75695	350 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ABHD16A	O95870	558 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	GSS	P48637	474 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	CENPA	P49450	140 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF81	P51508	661 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	MMP15	P51511	669 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	AQP6	Q13520	282 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	CCNI	Q14094	377 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	KCNMB1	Q16558	191 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	LEG1	Q6P5S2	330 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	RINL	Q6ZS11	566 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	TSSK2	Q96PF2	358 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	IFT27	Q9BW83	186 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	DECR2	Q9NUI1	292 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	B9D1	Q9UPM9	204 aa		10.09	□□□□□ -0.79
THBS3-208	ENST00000496332	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332		H3BSA7	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	TNFRSF11B	O00300	401 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	DCTN6	O00399	190 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	WNT9B	O14905	357 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	ARPC3	O15145	178 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	SPRY3	O43610	288 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	KRT36	O76013	467 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	GPANK1	O95872	356 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	T-ENOL	P0DO92	83 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	CALB2	P22676	271 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	CRABP1	P29762	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	CRYBB2	P43320	205 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	HMGA2	P52926	109 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	TSPAN31	Q12999	210 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	MTX3	Q5HYI7	312 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	USP51	Q70EK9	711 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	DHFR2	Q86XF0	187 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	OR4K13	Q8NH42	304 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	SLC7A6	Q92536	515 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	C1orf159	Q96HA4	380 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	NMNAT3	Q96T66	252 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		10.08	□□□□□ -0.8
THBS3-208	ENST00000496332	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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