RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 SEC14L5O43304 696 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZIC3O60481 467 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FCMRO60667 390 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 WISP2O76076 250 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SYNGR4O95473 234 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FADS2O95864 444 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CSTAP01040 98 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DBIP07108 87 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CHRM4P08173 479 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 GUSBP08236 651 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 NPIPA8P0DM63 369 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FCGR2AP12318 317 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ANXA8P13928 327 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 COX6B1P14854 86 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZNF17P17021 662 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PGCP20142 388 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FMO3P31513 532 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 IFNA8P32881 189 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 KDELR2P33947 212 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OPRM1P35372 400 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TIMP3P35625 211 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CDKN2CP42773 168 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SLC6A8P48029 635 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PCYT1AP49585 367 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 STARP49675 285 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 BMXP51813 675 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 GAS1P54826 345 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SMIM11AP58511 58 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 COPZ1P61923 177 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 KCNJ10P78508 379 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ADORA2A-AS1P86434 159 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PPP2R2BQ00005 443 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SPIBQ01892 262 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CD47Q08722 323 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 GTF3C1Q12789 2109 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FADDQ13158 208 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CBX3Q13185 183 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 VEZF1Q14119 521 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DGCR6Q14129 220 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 IFI44LQ53G44 452 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 KLHL26Q53HC5 615 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 LRIF1Q5T3J3 769 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OR2A2Q6IF42 318 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 USP43Q70EL4 1123 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OR8H3Q8N146 312 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FADS6Q8N9I5 356 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 POC5Q8NA72 575 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OR5W2Q8NH69 310 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 LILRB4Q8NHJ6 448 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 MCFD2Q8NI22 146 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZFP90Q8TF47 636 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 RNF138Q8WVD3 245 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SMPDL3BQ92485 455 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ITFG2Q969R8 447 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TAMM41Q96BW9 452 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 Q96MT0 163 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZFP3Q96NJ6 502 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 WDFY2Q96P53 400 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 MBOAT4Q96T53 435 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 EPYCQ99645 322 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 INPP5KQ9BT40 448 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 COPS4Q9BT78 406 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZNF350Q9GZX5 532 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 LAT2Q9GZY6 243 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 NTN4Q9HB63 628 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FANCFQ9NPI8 374 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DECR2Q9NUI1 292 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FLRT3Q9NZU0 649 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PEMTQ9UBM1 199 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 RNF6Q9Y252 685 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CARD8Q9Y2G2 431 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 IFT52Q9Y366 437 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms