RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GPR119Q8TDV5 335 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 AMELYQ99218 206 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 GAAP10253 952 aa6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 NPR2P20594 1047 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MELKQ14680 651 aa6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 C14orf79Q96F83 325 aa6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 ADAM19Q9H013 955 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 ALG1L2C9J202 215 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FABP7O15540 132 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SEC14L5O43304 696 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ATG12O94817 140 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR6A2O95222 327 aa6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 PTHLHP12272 177 aa6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 SRMP19623 302 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 IL11P20809 199 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 STARP49675 285 aa6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MED11Q9P086 117 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPL8 197 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 H3BML4 177 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DQB1P01920 261 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 BGLAPP02818 100 aa6.28□□□□□ -1.4
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