RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 RAG2P55895 527 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CORO6Q6QEF8 472 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 GPAT4Q86UL3 456 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 DMRTA2Q96SC8 542 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 GAL3ST1Q99999 423 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 LRP12Q9Y561 859 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR2T1O43869 369 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SIX6O95475 246 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ACY1Q03154 408 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 C17orf67Q0P5P2 114 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CLLU1Q5K131 121 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 Q7L0L9 218 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CA10Q9NS85 328 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 FBXL2Q9UKC9 423 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RARRES3Q9UL19 164 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PHYHO14832 338 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 LMX1BO60663 402 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 IL32P24001 234 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RAD52P43351 418 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 GUCA2AQ02747 115 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TEX30Q5JUR7 227 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR10G3Q8NGC4 313 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TMEM234Q8WY98 164 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SFXN2Q96NB2 322 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 GSX2Q9BZM3 304 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PPA2Q9H2U2 334 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR2J2O76002 312 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZNF432O94892 652 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 LPLP06858 475 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NR0B2Q15466 257 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 FDX2Q6P4F2 183 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZNF227Q86WZ6 799 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ASB10Q8WXI3 467 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 WBP1Q96G27 269 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NPIPA5E9PKD4 350 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 IGHMP01871 453 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 POU3F4P49335 361 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ROM1Q03395 351 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TLE3Q04726 772 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 GLO1Q04760 184 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 HLA-BQ31612 363 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 LINC00303Q3SY05 128 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 EID2Q8N6I1 236 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SAP25Q8TEE9 199 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 C5orf34Q96MH7 638 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CRB3Q9BUF7 120 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NOX3Q9HBY0 568 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZNF69Q9UC07 566 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CXCL2P19875 107 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms