RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 ABHD4Q8TB40 342 aa10.3□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 SLC7A6Q92536 515 aa10.3□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 BCL2L14Q9BZR8 327 aa10.3□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 TAAR3PQ9P1P4 343 aa10.3□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 ASH2LQ9UBL3 628 aa10.3□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa10.29□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 DOK2O60496 412 aa10.29□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 SPATA24Q86W54 205 aa10.29□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 CYB561A3Q8NBI2 242 aa10.29□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 NPEPL1Q8NDH3 523 aa10.29□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 OR52L1Q8NGH7 329 aa10.29□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 SLC25A40Q8TBP6 338 aa10.29□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 POM121Q96HA1 1249 aa10.29□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 POLR1DQ9Y2S0 133 aa10.29□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 VWC2LB2RUY7 222 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 BHLHE40O14503 412 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 RER1O15258 196 aa10.28□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 IDH3BO43837 385 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 HPXP02790 462 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 TP53P04637 393 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 TMEM255AQ5JRV8 349 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 ELFN2Q5R3F8 820 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 CORO6Q6QEF8 472 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 OR4Q3Q8NH05 313 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 UBASH3BQ8TF42 649 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 C4orf45Q96LM5 186 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 SNX18Q96RF0 628 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 WACQ9BTA9 647 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 DGCR6LQ9BY27 220 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 OR2J1Q9GZK6 312 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 MS4A5Q9H3V2 200 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 POFUT1Q9H488 388 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 TBC1D23Q9NUY8 699 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 PLEK2Q9NYT0 353 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-214ENST00000490425 IL20Q9NYY1 176 aa10.28□□□□□ -0.76
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NISCH-214ENST00000490425 OR6C6A6NF89 314 aa10.27□□□□□ -0.77
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NISCH-214ENST00000490425 CD5LO43866 347 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 NCR1O76036 304 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ABHD16AO95870 558 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 IGHV3-13P01766 116 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 TFP02787 698 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 DBHP09172 617 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 COX5BP10606 129 aa10.27□□□□□ -0.77
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