RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 LRP5LA4QPB2 252 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMB11A5LHX3 300 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 TRDCB7Z8K6 153 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 D6RAR5 112 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 C19orf84I3L1E1 186 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 K7EQM0 130 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CXCL13O43927 109 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10H3O60404 316 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0754O94854 1291 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SNAPINO95295 136 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 MGMTP16455 207 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP6V1B2P21281 511 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 HTR1FP30939 366 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 UCNP55089 124 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM69Q86WT6 500 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2L13Q8N349 312 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKFN1Q8N957 763 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 DCAF4L2Q8NA75 395 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SYT14Q8NB59 555 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4D5Q8NGN0 318 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 RNF138Q8WVD3 245 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 RMND5AQ9H871 391 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 TREM2Q9NZC2 230 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PISDQ9UG56 409 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PCSK1NQ9UHG2 260 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 GGA2Q9UJY4 613 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX6Q9UNH7 406 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 NEU3Q9UQ49 428 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 MEMO1Q9Y316 297 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX10Q9Y5X0 201 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CDH10Q9Y6N8 788 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 METTL21EPA6NDL7 271 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 LAD1O00515 517 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 NDC80O14777 642 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC31A1O15431 190 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 NPIPB7O75200 414 aa2.16□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 ANXA13P27216 316 aa2.16□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 PTGDSP41222 190 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 C21orf59P57076 290 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP24A1Q07973 514 aa2.16□□□□□ -2.06
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RABGGTB-211ENST00000489450 ARL6IP1Q15041 203 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf146Q5VVC0 180 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM173BQ6P4H8 233 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 IGFL2Q6UWQ7 119 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC80Q76M96 950 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CD302Q8IX05 232 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF683Q8IZ20 524 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM123Q8N131 208 aa2.16□□□□□ -2.06
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