RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 CDC73Q6P1J9 531 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 VHLLQ6RSH7 139 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ABHD13Q7L211 337 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CA13Q8N1Q1 262 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RHCGQ9UBD6 479 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A0A0D9SG52 128 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GSAPA4D1B5 854 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 VSTM5A8MXK1 200 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 F5H5P2 479 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 YIF1AO95070 293 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TYRP1P17643 537 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 AKR1C2P52895 323 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 AKR1C1Q04828 323 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FOXC1Q12948 553 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CT55Q8WUE5 264 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C5orf34Q96MH7 638 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 AP4M1O00189 453 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RDH16O75452 317 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SCRG1O75711 98 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CLDN9O95484 217 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 HOXB5P09067 269 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 HOXA5P20719 270 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MTNR1AP48039 350 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CLDN6P56747 220 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RAB38P57729 211 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 APIPQ96GX9 242 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 BOD1Q96IK1 185 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF649Q9BS31 505 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A6NNC1 897 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FAAHO00519 579 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SLC25A12O75746 678 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IFNW1P05000 195 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GKN3PP0CG01 181 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ETFAP13804 333 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 COX7A2P14406 83 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LIFP15018 202 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GDF5P43026 501 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OMPP47874 163 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ART1P52961 327 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SCARB2Q14108 478 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DNLZQ5SXM8 178 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RCE1Q9Y256 329 aa6.9□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PLPP1O14494 284 aa6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RNF13O43567 381 aa6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ACTL6AO96019 429 aa6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PMP2P02689 132 aa6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SERPIND1P05546 499 aa6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 MNDAP41218 407 aa6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RAB5CP51148 216 aa6.9□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TMPRSS3P57727 454 aa6.9□□□□□ -1.31
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