RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477941.2

PDE4DIP-212, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4DIP, Length 586 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-212ENST00000477941 CMTM6Q9NX76 183 aa11.07□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ARMCX1Q9P291 453 aa11.07□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 OPN4Q9UHM6 478 aa11.07□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 KLHL21Q9UJP4 597 aa11.07□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.07□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 A0A087WUU8 490 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 CDC42EP2O14613 210 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 DOK2O60496 412 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 GSTM3P21266 225 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 GATA3P23771 443 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 HTR5AP47898 357 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SLC9A3P48764 834 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 LIPEQ05469 1076 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ANKDD1AQ495B1 522 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 OTPQ5XKR4 325 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SYT9Q86SS6 491 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 OR2Z1Q8NG97 314 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ST7LQ8TDW4 575 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q96M85 177 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 NPTNQ9Y639 398 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.06□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TMEM89A2RUT3 159 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 CXCR6O00574 342 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 XKRYO14609 159 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SGCEO43556 437 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 FOXH1O75593 365 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 PRSS23O95084 383 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 CD14P08571 375 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SBK2P0C263 348 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 CTLA4P16410 223 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 LIMS1P48059 325 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 CDK5R2Q13319 367 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 IFI44LQ53G44 452 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 MESTQ5EB52 335 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TREML1Q86YW5 311 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SLC15A3Q8IY34 581 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 HSH2DQ96JZ2 352 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 RERGLQ9H628 205 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ESM1Q9NQ30 184 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TMEM106BQ9NUM4 274 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 PRSS37A4D1T9 235 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 GSTA4O15217 222 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 FSHBP01225 129 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 IGHV2-70P01814 119 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 COX5BP10606 129 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TNFSF4P23510 183 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SLC7A2P52569 658 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZBED5Q49AG3 693 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q6ZR03 302 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SPICQ8N5J4 248 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SLC7A6Q92536 515 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 RASD2Q96D21 266 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 CMBLQ96DG6 245 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZNF570Q96NI8 536 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 MMP26Q9NRE1 261 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ASH2LQ9UBL3 628 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 STARD10Q9Y365 291 aa11.04□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 PPIAL4EA0A075B759 164 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 PPIAL4DF5H284 164 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 NME4O00746 187 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SLC22A2O15244 555 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 AHCYL1O43865 530 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SERPINA1P01009 418 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 PPIAL4FP0DN26 164 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 TNFRSF1AP19438 455 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 KITLGP21583 273 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 FPR2P25090 351 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 ERFP50548 548 aa11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PDE4DIP-212ENST00000477941 AQP6Q13520 282 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms