RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB3BP20337 219 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.913e-10■■□□□ 13.3
RABGGTB-207ENST00000470201 LONP1P36776 959 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 NBL1P41271 181 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 CXCL5P42830 114 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 RND2P52198 227 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 CARD18P57730 90 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 QPRTQ15274 297 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPN20Q4JDL3 420 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 ULK3Q6PHR2 472 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF429Q86V71 674 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 CSPG4P5Q96PW8 444 aa3.13□□□□□ -1.91
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RABGGTB-207ENST00000470201 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 ASB8Q9H765 288 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM9BQ9NQ34 198 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 CD84Q9UIB8 345 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR62O43379 1518 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0J9YYE9 177 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 A6NDX4 124 aa3.12□□□□□ -1.91
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RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 CHMP2AO43633 222 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 TRBC1P01850 177 aa3.12□□□□□ -1.91
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RABGGTB-207ENST00000470201 Q8N9W7 124 aa3.12□□□□□ -1.91
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RABGGTB-207ENST00000470201 GPR1P46091 355 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 LHX2P50458 406 aa3.11□□□□□ -1.91
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RABGGTB-207ENST00000470201 A8MU10 97 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-207ENST00000470201 PES1O00541 588 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
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