RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT36O76013 467 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NCR1O76036 304 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNB2O95067 398 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX14O95416 240 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CST1P01037 141 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 TFP02787 698 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 HPXP02790 462 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ADRA2AP08913 450 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RAP2AP10114 183 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CLUP10909 449 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NAT2P11245 290 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 APEHP13798 732 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MSR1P21757 451 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNOP22674 350 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 STOMP27105 288 aa6□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A6P31641 620 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 PYCR1P32322 319 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 PPOXP50336 477 aa6□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 EFNA4P52798 201 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC36A2Q495M3 483 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OXLD1Q5BKU9 147 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ELFN2Q5R3F8 820 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA46Q5T0L3 261 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR139Q6DWJ6 353 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSM5Q6NUN0 579 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CORO6Q6QEF8 472 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NAA40Q86UY6 237 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA24Q86W54 205 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 AQP12AQ8IXF9 295 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 YIPF5Q969M3 257 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX7Q9BT81 388 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 IFT27Q9BW83 186 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 DGCR6LQ9BY27 220 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 TMCC3Q9ULS5 477 aa6□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 LHFPL6Q9Y693 200 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SONP18583 2426 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NF1P21359 2839 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS12A0PJE2 317 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf49A4QMS7 147 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf63A6NC05 138 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 XKRYO14609 159 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 AHCYL1O43865 530 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FKBP6O75344 327 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 TIPRLO75663 272 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 STAMBPO95630 424 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SNAP29O95721 258 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 GYPBP06028 91 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 LCKP06239 509 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 HEXAP06865 529 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 VSIG8P0DPA2 414 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF250P15622 560 aa5.99□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 APLNRP35414 380 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEB1P43366 347 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 EVX1P49640 407 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H3AP68431 136 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 HSF2Q03933 536 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNIQ14094 377 aa5.99□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 BIVMQ86UB2 503 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ICA1LQ8NDH6 482 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51L1Q8NGJ5 315 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FNDC8Q8TC99 324 aa5.99□□□□□ -1.45
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