RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	POU1F1	P28069	291 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	CRISP1	P54107	249 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H3A	P68431	136 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	TEK	Q02763	1124 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	CRMP1	Q14194	572 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	GINS1	Q14691	196 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	RAB35	Q15286	201 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ARL9	Q6T311	187 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	FN3K	Q9H479	309 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	EMC7	Q9NPA0	242 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		12.63	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	SURF4	O15260	269 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	SYNGR3	O43761	229 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	OR4A8	P0C604	315 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	SPI1	P17947	270 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	IGFBP5	P24593	272 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	FMO3	P31513	532 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	THBS4	P35443	961 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	UCP2	P55851	309 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PPP2R2B	Q00005	443 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ECH1	Q13011	328 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ZSCAN26	Q16670	478 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PCK2	Q16822	640 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	TEX30	Q5JUR7	227 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	KRT80	Q6KB66	452 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF774	Q6NX45	483 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	COG8	Q96MW5	612 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	S100A14	Q9HCY8	104 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf49	A4QMS7	147 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	OR6C6	A6NF89	314 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PRODH	O43272	600 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	MPZL1	O95297	269 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-DQA2	P01906	255 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	TF	P02787	698 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF250	P15622	560 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF823	P16415	610 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	GGT2	P36268	569 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	HTR5A	P47898	357 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PPOX	P50336	477 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5J2	P56134	94 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	SELENOV	P59797	346 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	COQ7	Q99807	217 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	MARCH7	Q9H992	704 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	GPR160	Q9UJ42	338 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	F8	P00451	2351 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ZAR1L	A6NP61	321 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PYCR1	P32322	319 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	RGS6	P49758	472 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	MOG	Q16653	247 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	STMN2	Q93045	179 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PTP4A1	Q93096	173 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PERP	Q96FX8	193 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	PKP2	Q99959	881 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	USE1	Q9NZ43	259 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
PTPA-222	ENST00000445241	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		12.6	□□□□□ -0.39

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