RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441998.5

NELFE-205, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NELFE, Length 1,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-205ENST00000441998 Q96M85 177 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 NSMCE2Q96MF7 247 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ZNF570Q96NI8 536 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 DECR2Q9NUI1 292 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.52□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CR1P17927 2039 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 LRP5LA4QPB2 252 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 UNC119BA6NIH7 251 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CD55P08174 381 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 GSTM3P21266 225 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ATP6V1B2P21281 511 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CCNOP22674 350 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 FPR3P25089 353 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 RGS6P49758 472 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ZNF81P51508 661 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 MMP15P51511 669 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 MS4A2Q01362 244 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 SCGB2A2Q13296 93 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 HFEQ30201 348 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 RFX4Q33E94 735 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 MESTQ5EB52 335 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 MTX3Q5HYI7 312 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 FGD3Q5JSP0 725 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 IGFN1Q86VF2 1251 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 TIMD4Q96H15 378 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 MUC13Q9H3R2 512 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 FZR1Q9UM11 496 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.51□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.894e-9■■■■□ 26.6
NELFE-205ENST00000441998 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 A0A1W2PPL8 197 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 SGCEO43556 437 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 SLC16A7O60669 478 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 NCR1O76036 304 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 GADD45GO95257 159 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 FABP3P05413 133 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CTLA4P16410 223 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CPT2P23786 658 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 SLC6A6P31641 620 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 MAGEB1P43366 347 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 PPP1CBP62140 327 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CCL8P80075 99 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 BNIP1Q12981 228 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 SEC23BQ15437 767 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CR1LQ2VPA4 569 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 LCN8Q6JVE9 175 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ZNF774Q6NX45 483 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 GLCCI1Q86VQ1 547 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 GJC3Q8NFK1 279 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ABHD4Q8TB40 342 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 RAB1CQ92928 201 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 PTP4A1Q93096 173 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 YIPF5Q969M3 257 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 TRIM15Q9C019 465 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 SAP30LQ9HAJ7 183 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.5□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 A0A0A6YYJ9 748 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 OR6C6A6NF89 314 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 CLDN25C9JDP6 229 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ACOT8O14734 319 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ABHD16AO95870 558 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 LYNX1P0DP58 116 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 KITLGP21583 273 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 GATA3P23771 443 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 FXYD6P3P58550 94 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ERVS71-1P61550 626 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 LMO4P61968 165 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 HIST1H3AP68431 136 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 GLO1Q04760 184 aa9.49□□□□□ -0.89
NELFE-205ENST00000441998 ECH1Q13011 328 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms