RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 OR2T4Q8NH00 348 aa15.51■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 NRBF2Q96F24 287 aa15.51■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 SORCS2Q96PQ0 1159 aa15.51■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 BDH2Q9BUT1 245 aa15.51■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 BCL2L14Q9BZR8 327 aa15.51■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 DYNLRB1Q9NP97 96 aa15.51■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 PLEK2Q9NYT0 353 aa15.51■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 H7C1Q1 480 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 IFNGP01579 166 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 HLA-DQA2P01906 255 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 TFP02787 698 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 COX5BP10606 129 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 OSMP13725 252 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 FASP25445 335 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 PYCR1P32322 319 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 GRK5P34947 590 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 WNT5AP41221 380 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 HTR5AP47898 357 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 EVX1P49640 407 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 PPOXP50336 477 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 EFNA4P52798 201 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 TEKQ02763 1124 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 CRMP1Q14194 572 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 LRP11Q86VZ4 500 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 OR10H5Q8NGA6 315 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 OR1J1Q8NGS3 322 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 OR5K1Q8NHB7 308 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 C18orf12Q96KH6 178 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 KIF17Q9P2E2 1029 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 DUSP13Q9UII6 198 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 LHFPL6Q9Y693 200 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 F8P00451 2351 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa15.5■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ITPR3Q14573 2671 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 RER1O15258 196 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 LY6HO94772 140 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 FCGR1AP12314 374 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 FOSL1P15407 271 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 TNK1Q13470 666 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 CORO6Q6QEF8 472 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 DNM1P46Q6ZS02 220 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ZNF101Q8IZC7 436 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 RAB1BQ9H0U4 201 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 CMC2Q9NRP2 79 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 VPS13CQ709C8 3753 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 HIVEP1P15822 2718 aa15.49■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PPW3 197 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 M0R233 179 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 SYNGR3O43761 229 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 F12P00748 615 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ADRA2AP08913 450 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ZNF3P17036 446 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 SLC25A1P53007 311 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 GINS1Q14691 196 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 AMIGO2Q86SJ2 522 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ZNF525Q8N782 197 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 GJC3Q8NFK1 279 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ABHD4Q8TB40 342 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 SYNPRQ8TBG9 265 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 C4orf45Q96LM5 186 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 OR6C6A6NF89 314 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 TVP23AA6NH52 213 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 G3V2T6 193 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ICMTO60725 284 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 CLPTM1O96005 669 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 GYPBP06028 91 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 INHBBP09529 407 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ZNF250P15622 560 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ZNF823P16415 610 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 SPI1P17947 270 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ALDH3B1P43353 468 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 DAPP51397 102 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 SELENOVP59797 346 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 ACTR3P61158 418 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-205ENST00000426683 HIST1H3AP68431 136 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms