RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FOXF2Q12947 444 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 KRTCAP3Q53RY4 240 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 FAM220AQ7Z4H9 259 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 KRT77Q7Z794 578 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 ZNF100Q8IYN0 542 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 GHSRQ92847 366 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 SLAMF6Q96DU3 332 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 FBXO17Q96EF6 278 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 MROQ9BYG7 248 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 STUB1Q9UNE7 303 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 OGG1O15527 345 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 PNPP00491 289 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 PATE4P0C8F1 98 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 NFATC3Q12968 1075 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 UBE2J2Q8N2K1 259 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R14AQ96A00 147 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 FOXB1Q99853 325 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 SLX1AQ9BQ83 275 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 FRRS1LQ9P0K9 344 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 FAM215AQ9Y5M1 114 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 KALRNO60229 2985 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 RELNP78509 3460 aa17.71■□□□□ 0.43
ODC1-202ENST00000405333 CD8B2A6NJW9 211 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 TMCC2O75069 709 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 CD8BP10966 210 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 FAPQ12884 760 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 GUSBP1Q15486 140 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 RNF133Q8WVZ7 376 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 LINC00470Q9BZP3 86 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 TOXO94900 526 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 TACSTD2P09758 323 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 OPRL1P41146 370 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 GDI2P50395 445 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 TAS2R43P59537 309 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 LSM6P62312 80 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 LY6DQ14210 128 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 ODF4Q2M2E3 257 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 C22orf42Q6IC83 251 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 KLHL24Q6TFL4 600 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 TMEM91Q6ZNR0 172 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 PRSS35Q8N3Z0 413 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 FGFBP3Q8TAT2 258 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 WNT2BQ93097 391 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 SMIM19Q96E16 107 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 C1orf198Q9H425 327 aa17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 DOK2O60496 412 aa17.69■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 ZFPL1O95159 310 aa17.69■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 ABOP16442 354 aa17.69■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 FAM27BQ5VT28 67 aa17.69■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 VWA1Q6PCB0 445 aa17.69■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A18Q9H1K4 315 aa17.69■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 SIAEQ9HAT2 523 aa17.69■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 UPB1Q9UBR1 384 aa17.69■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 A0A096LPE4 126 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PPZ6 126 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 ZNF587BE7ETH6 402 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 H3BSH0 61 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 SLC22A1O15245 554 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 ANOS1P23352 680 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 MAGEB1P43366 347 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 ARF1P84077 181 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 GPR50Q13585 617 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 FAM214BQ7L5A3 538 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 SLC22A24Q8N4F4 322 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 OR2G2Q8NGZ5 317 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 GP6Q9HCN6 339 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 TMEM8BA6NDV4 472 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 GABRPO00591 440 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 KIR3DL2P43630 455 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 TGM4P49221 684 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 RIDAP52758 137 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 CCDC58Q4VC31 144 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 FAM27D1Q5T7N8 215 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 ZNF813Q6ZN06 617 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 SKA3Q8IX90 412 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 RDH10Q8IZV5 341 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 NAXEQ8NCW5 288 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 FAM57AQ8TBR7 257 aa17.68■□□□□ 0.42
ODC1-202ENST00000405333 RPS4Y2Q8TD47 263 aa17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms