RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.97□□□□□ -0.97
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HERC3-202ENST00000402738 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.97□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 PADI1Q9ULC6 663 aa8.97□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.97□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.96□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 E5RGE8 158 aa8.96□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 IGF2P01344 180 aa8.96□□□□□ -0.97
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HERC3-202ENST00000402738 HNF1AP20823 631 aa8.96□□□□□ -0.97
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HERC3-202ENST00000402738 M0R143 59 aa8.96□□□□□ -0.97
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HERC3-202ENST00000402738 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.96□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 STPG2Q8N412 459 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 NUBPLQ8TB37 319 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 LHX4Q969G2 390 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 UCK1Q9HA47 277 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 GHRLQ9UBU3 117 aa8.95□□□□□ -0.98
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