RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SYT5O00445 386 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 DVL1O14640 695 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SELENOFO60613 162 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SOX18P35713 384 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 VEGFBP49765 207 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ARSGQ96EG1 525 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 TRIB1Q96RU8 372 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 POFUT1Q9H488 388 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CA14Q9ULX7 337 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 FBP1P09467 338 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 GLI4P10075 376 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SELEP16581 610 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 NPPBP16860 134 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 P2RY2P41231 377 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CXCL12P48061 93 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CLDN20P56880 219 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 PLPP6Q8IY26 295 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ZNRF4Q8WWF5 429 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 RASD2Q96D21 266 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 Q96M85 177 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 DECR2Q9NUI1 292 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CCL26Q9Y258 94 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 F5P12259 2224 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM77I1YAP6 450 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CPEP16870 476 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 AANATQ16613 207 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 NKG7Q16617 165 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZSR6 202 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 RAB18Q9NP72 206 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 RAB22AQ9UL26 194 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 H7BYZ3 331 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 P2RY10O00398 339 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 TESK1Q15569 626 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 XAF1Q6GPH4 301 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 BTNL8Q6UX41 500 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 OR51A2Q8NGJ7 313 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 OR5K2Q8NHB8 316 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 TPPP3Q9BW30 176 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 GFYI3L273 518 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CNIH1O95406 144 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 SPP1P10451 314 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CTRB1P17538 263 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 EMP3P54852 163 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 YPEL5P62699 121 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ADIRFQ15847 76 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM64Q6YI46 380 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 USP51Q70EK9 711 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 PIGQQ9BRB3 760 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ZBP1Q9H171 429 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 OR51B6Q9H340 312 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CHEK1O14757 476 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 TAAR5O14804 337 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 HRO43593 1189 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 LIPNQ5VXI9 398 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 OR5B3Q8NH48 314 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 PFN4Q8NHR9 129 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 PDXPQ96GD0 296 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 WDR76Q9H967 626 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-202ENST00000400053 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.12□□□□□ -1.11
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