RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 SSR3Q9UNL2 185 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRHP06850 196 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 GABRA5P31644 462 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 PEX19P40855 299 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 USP43Q70EL4 1123 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10H5Q8NGA6 315 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 NELFAQ9H3P2 528 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 MALT1Q9UDY8 824 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 OSGIN2Q9Y236 505 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 E9PI62 339 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 LINC00346Q8IVM7 164 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 KBTBD8Q8NFY9 601 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXB1Q99853 325 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM38BQ9NVV0 291 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGSF10Q6WRI0 2623 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAS2R43P59537 309 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNMB1Q16558 191 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 OTOSQ8NHW6 89 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 MNTQ99583 582 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDADC1Q9BWV3 514 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAMP5Q9UJQ1 280 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNG8Q9UK08 70 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0G2JNJ9 132 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 VGLL3A8MV65 326 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CGAP01215 116 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 B4GALT1P15291 398 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 MSR1P21757 451 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CASP6P55212 293 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR50Q13585 617 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CORO6Q6QEF8 472 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC18Q8N456 261 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q9UFV3 132 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 PROCRQ9UNN8 238 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL6A6A6NMZ7 2263 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTSSP25774 331 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CA7P43166 264 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 TUBA1BP68363 451 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARF1P84077 181 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCK2Q16822 640 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 TEX30Q5JUR7 227 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 TUBA1AQ71U36 451 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 THEM6Q8WUY1 208 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 PELI1Q96FA3 418 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMED9Q9BVK6 235 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF416Q9BWM5 594 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 KALRNO60229 2985 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRR32B1ATL7 298 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 E9PLN8 166 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALOX5APP20292 161 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPR2P20594 1047 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINB10P48595 397 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
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TRAPPC10-202ENST00000380221 VKORC1Q9BQB6 163 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 SFXN3Q9BWM7 321 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIAEQ9HAT2 523 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLR1DQ9Y2S0 133 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 LHFPL6Q9Y693 200 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 STK11Q15831 433 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 DGUOKQ16854 277 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF684Q5T5D7 378 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF610Q8N9Z0 462 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 DMRTA2Q96SC8 542 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 SH3GL3Q99963 347 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEMO1Q9Y316 297 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSMD9O00233 223 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGA5P08648 1049 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSM6P62312 80 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 FABP5Q01469 135 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL24Q6TFL4 600 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF813Q6ZN06 617 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC22A24Q8N4F4 322 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACOXLQ9NUZ1 547 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASH2LQ9UBL3 628 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPG5Q9HCE0 2579 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHYHO14832 338 aa24.32■■□□□ 1.48
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