RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 OR2T29Q8NH02 315 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 AKR7LQ8NHP1 331 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SYNPRQ8TBG9 265 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 RASD2Q96D21 266 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 OR2H1Q9GZK4 316 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SHARPINQ9H0F6 387 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SYT4Q9H2B2 425 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 REEP1Q9H902 201 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 LPAR3Q9UBY5 353 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 H7C1C5 153 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ICMTO60725 284 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 NCR1O76036 304 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 CCNB2O95067 398 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 CCNOP22674 350 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 GDI2P50395 445 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 LCN6P62502 163 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SCRN3Q0VDG4 424 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 MOGQ16653 247 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 NKPD1Q17RQ9 610 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF620Q6ZNG0 422 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 IL17RELQ6ZVW7 336 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 JAZF1Q86VZ6 243 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ICA1LQ8NDH6 482 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 C11orf40Q8WZ69 217 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF416Q9BWM5 594 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 LOC100509620A0A075B734 347 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SOCS2O14508 198 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SLC16A7O60669 478 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 CTLA4P16410 223 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ARL9Q6T311 187 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 OR1J1Q8NGS3 322 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 RDH5Q92781 318 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 YIPF5Q969M3 257 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 IFT27Q9BW83 186 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 WNT5BQ9H1J7 359 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 H3BSA7 217 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 RENP00797 406 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 GSTM3P21266 225 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 TUBG1P23258 451 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 NOS3P29474 1203 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 WNT5AP41221 380 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 MAGEB1P43366 347 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 RASSF2P50749 326 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 AQP6Q13520 282 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 KCNMB1Q16558 191 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 MICAQ29983 383 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 FAM120AOSQ5T036 256 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 YY1AP1Q9H869 796 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 TUBG2Q9NRH3 451 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 IL20Q9NYY1 176 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ATPIF1Q9UII2 106 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 C5orf49A4QMS7 147 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 C17orf100A8MU93 164 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ATP5HO75947 161 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R3DO95685 299 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SCG5P05408 212 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ACHEP22303 614 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 HPS1Q92902 700 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SAMD8Q96LT4 415 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 NUAK2Q9H093 628 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ELOVL3Q9HB03 270 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-201ENST00000378543 ARRDC5A6NEK1 342 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 GLO1Q04760 184 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 CCNIQ14094 377 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 SNX33Q8WV41 574 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 CHID1Q9BWS9 393 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 MXRA5Q9NR99 2828 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 DHRS12A0PJE2 317 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-201ENST00000378543 RP2O75695 350 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms