RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371219.2

RBM38-204, Transcript of RNA binding motif protein 38, human

TSL 2 BASIC

Gene RBM38, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM38-204	ENST00000371219	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	POLQ	O75417	2590 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	OR6C6	A6NF89	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	SNTN	A6NMZ2	147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	HS3ST1	O14792	307 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	DOK2	O60496	412 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	SCG5	P05408	212 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	GYPB	P06028	91 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF35	P13682	527 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	PRF1	P14222	555 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	STOM	P27105	288 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	GSTT1	P30711	240 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	APLNR	P35414	380 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	CDH11	P55287	796 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	POU4F2	Q12837	409 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	IL18R1	Q13478	541 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	RAB39A	Q14964	217 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	TTC23	Q5W5X9	447 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	LPCAT4	Q643R3	524 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF544	Q6NX49	715 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	SLC22A25	Q6T423	547 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	SHF	Q7M4L6	423 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	HTRA1	Q92743	480 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	FBXW5	Q969U6	566 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	INTS14	Q96SY0	518 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	COQ7	Q99807	217 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	APOL4	Q9BPW4	351 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	MED20	Q9H944	212 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219		H0YAE9	185 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219		H3BSA7	217 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	DLGAP1	O14490	977 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	SYNGR3	O43761	229 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	MPZL1	O95297	269 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	CELA3B	P08861	270 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	PATE4	P0C8F1	98 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	CLU	P10909	449 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	GALK2	Q01415	458 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	KLHL12	Q53G59	568 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	ARL9	Q6T311	187 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	TIGD4	Q8IY51	512 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF611	Q8N823	705 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	OTULIN	Q96BN8	352 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	MNT	Q99583	582 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	CDH20	Q9HBT6	801 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM38-204	ENST00000371219		A0A1W2PPR1	153 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	ATP6V1G2	O95670	118 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	TUBG1	P23258	451 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	HTR1F	P30939	366 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	HTR5A	P47898	357 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	NUDT6	P53370	316 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	SPOCK1	Q08629	439 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	APOF	Q13790	326 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	MEP1B	Q16820	701 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM38-204	ENST00000371219	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37

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