RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINB12Q96P63 405 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RHOXF2Q9BQY4 288 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 NEK6Q9HC98 313 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ16Q9NPI9 418 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC2A8Q9NY64 477 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PISDQ9UG56 409 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP45Q9UL16 551 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 STARD10Q9Y365 291 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PLA2R1Q13018 1463 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 HEATR9A2RTY3 570 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 WRBO00258 174 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC7O00311 574 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 EEDO75530 441 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RBBP9O75884 186 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 VAMP5O95183 116 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 OTCP00480 354 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RALBP11234 206 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF250P15622 560 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CPN2P22792 545 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CHMLP26374 656 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 NSG1P42857 185 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 MXD1Q05195 221 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 TGM3Q08188 693 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 DMTNQ08495 405 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PON2Q15165 354 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPN20Q4JDL3 420 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZSR3 168 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXL13Q8NEE6 735 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA4Q8NEY3 305 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4C5Q8NGB2 326 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF461Q8TAF7 563 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF721Q8TF20 911 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 C19orf60Q96EN9 201 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CHP1Q99653 195 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP5SQ99766 215 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CTRCQ99895 268 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM192AQ9GZU8 254 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 AUNIPQ9H7T9 357 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 UVRAGQ9P2Y5 699 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 GGA2Q9UJY4 613 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ST3GAL6Q9Y274 331 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 TNS2Q63HR2 1409 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1B0GTQ1 180 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFS8O00217 210 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CLPXO76031 633 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PAHP00439 452 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CD5P06127 495 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00869P0C866 280 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CCNB1P14635 433 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB3BP20337 219 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SYKP43405 635 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CLDN8P56748 225 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 DOC2AQ14183 400 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL40Q2TBA0 621 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 XKR4Q5GH76 650 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SPANXN2Q5MJ10 180 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 THEM4Q5T1C6 240 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PRMT9Q6P2P2 845 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF880Q6PDB4 577 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PLET1Q6UQ28 207 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SASS6Q6UVJ0 657 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM107Q6UX40 140 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXW12Q6X9E4 464 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 HMGN2P46Q86SG4 172 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 IQCF2Q8IXL9 164 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PDCL2Q8N4E4 241 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 COMMD1Q8N668 190 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF321PQ8N8H1 164 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNG3Q8TAE7 436 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF502Q8TBZ5 544 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ESR2Q92731 530 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 MCUR1Q96AQ8 359 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00477Q96M19 166 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf70Q9BRQ4 267 aa2.1□□□□□ -2.07
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