RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370018.7

RTEL1-205, Transcript of regulator of telomere elongation helicase 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTEL1, Length 4,955 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTEL1-205	ENST00000370018	TGOLN2	O43493	480 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	MT-ND4L	P03901	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	GAL	P22466	123 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	P2RX1	P51575	399 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	GSG1	Q2KHT4	349 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	F5	P12259	2224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	TBX19	O60806	448 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	PMPCA	Q10713	525 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	LPAL2	Q16609	132 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	AGBL4	Q5VU57	503 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	GALNT16	Q8N428	558 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	CD3D	P04234	171 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	NQO2	P16083	231 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	SLC6A1	P30531	599 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	ECI1	P42126	302 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	LYPD8	Q6UX82	237 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	NME2P1	O60361	137 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	MT-CO2	P00403	227 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	SRPX	P78539	464 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-205	ENST00000370018	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	FOLR1	P15328	257 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	SCRG1	O75711	98 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	CHRM2	P08172	466 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	CD1C	P29017	333 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	SELENOV	P59797	346 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	FCRL6	Q6DN72	434 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	TMEM235	A6NFC5	223 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	CBX7	O95931	251 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	SLC6A18	Q96N87	628 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	CMTM3	Q96MX0	182 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	OR6C76	A6NM76	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	NDUFB6	O95139	128 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	WNT1	P04628	370 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	DIO1	P49895	249 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	SRY	Q05066	204 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	RIN1	Q13671	783 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018		A6NLC8	198 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	EFNA3	P52797	238 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	EPHA4	P54764	986 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-205	ENST00000370018	DERL3	Q96Q80	235 aa		13.69	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms