RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF254O75437 659 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SULT1C4O75897 302 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 INMTO95050 263 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 UBL3O95164 117 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TFAP2AP05549 437 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ADRA2AP08913 450 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CD79AP11912 226 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 BMP5P22003 454 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OR12D2P58182 307 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GRB2P62993 217 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RAB39AQ14964 217 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PCK2Q16822 640 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OR7E24Q6IFN5 339 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LRRN1Q6UXK5 716 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LUZP2Q86TE4 346 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 KLBQ86Z14 1044 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 EGFL6Q8IUX8 553 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF679Q8IYX0 411 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 NAXEQ8NCW5 288 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 COG8Q96MW5 612 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 BABAM2Q9NXR7 383 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PLEK2Q9NYT0 353 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 Q9UFV3 132 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LHFPL6Q9Y693 200 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GUH1 482 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CCRL2O00421 344 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MSTNO14793 375 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SGCEO43556 437 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 DOK2O60496 412 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RAD51DO75771 328 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LYZL6O75951 148 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RPP14O95059 124 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ITGA5P08648 1049 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV1-2P23083 117 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 IL32P24001 234 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ARR3P36575 388 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ALDH3B2P48448 385 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 BDH1Q02338 343 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PLP2Q04941 152 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 P2RY6Q15077 328 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TSTQ16762 297 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 DEGS2Q6QHC5 323 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CFAP77Q6ZQR2 320 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF627Q7L945 461 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MRGPRGQ86SM5 289 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SATL1Q86VE3 508 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SKA3Q8IX90 412 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC36Q8IYA8 594 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ST7LQ8TDW4 575 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ATF6BQ99941 703 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 NIPAL2Q9H841 368 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ELOVL3Q9HB03 270 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LRP12Q9Y561 859 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RER1O15258 196 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CGAP01215 116 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 APOC1P02654 83 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PSKH1P11801 424 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF32P17041 273 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CD79BP40259 229 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ROM1Q03395 351 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TLE1Q04724 770 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ACSM1Q08AH1 577 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RAB35Q15286 201 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TBRG1Q3YBR2 411 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ELFN2Q5R3F8 820 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MTFR2Q6P444 385 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 FJX1Q86VR8 437 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GALNT11Q8NCW6 608 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PRR7Q8TB68 274 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RNF133Q8WVZ7 376 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SPTSSAQ969W0 71 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 FBXO17Q96EF6 278 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC46Q96FV0 321 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MAP6Q96JE9 813 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.4 ms