RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM180AQ6UWF9 173 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C16orf89Q6UX73 402 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASCL4Q6XD76 172 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASPGQ86U10 573 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARMC8Q8IUR7 673 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYTL1Q8IYJ3 562 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR5D18Q8NGL1 313 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR10Z1Q8NGY1 313 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCAMP5Q8TAC9 235 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIPOL1Q8TD10 442 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC20A1Q8WUM9 679 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSPH1Q92598 858 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MFSD3Q96ES6 412 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ELMOD3Q96FG2 381 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PERPQ96FX8 193 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS39Q96JC1 886 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFP3Q96NJ6 502 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NMNAT3Q96T66 252 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DSCC1Q9BVC3 393 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR63Q9BZJ6 419 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRABDQ9H4I3 376 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CWH43Q9H720 699 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAGEF1Q9HAY2 307 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCB6Q9NP58 842 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CORO2BQ9UQ03 480 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SH2B3Q9UQQ2 575 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRKAB1Q9Y478 270 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WIZO95785 1651 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCB11O95342 1321 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A6NDX4 124 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F5H768 121 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INS-IGF2F8WCM5 200 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H0YIZ8 118 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AP3B1O00203 1094 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC28A1O00337 649 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDIPTO14735 213 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCO2O43819 266 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNH1O95259 989 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPBPP02775 128 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRKAR1AP10644 381 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DRD1P21728 446 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRK2P25098 689 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HTR2CP28335 458 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STAT2P52630 851 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPS6P62753 249 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ART3Q13508 389 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB33AQ14088 237 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIZQ2M2Z5 673 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MS4A18Q3C1V0 323 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MEDAGQ5VYS4 303 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FIGLAQ6QHK4 219 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LHFPL3Q86UP9 236 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC38A6Q8IZM9 456 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CARNMT1Q8N4J0 409 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF781Q8N8C0 355 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AQP11Q8NBQ7 271 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR4X1Q8NH49 305 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR2W6PQ8NHA6 318 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC25A40Q8TBP6 338 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CASTOR1Q8WTX7 329 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABHD3Q8WU67 409 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLAMF6Q96DU3 332 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 L3HYPDHQ96EM0 354 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FEM1CQ96JP0 617 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLT1D1Q96MS3 346 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LGMNQ99538 433 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HINT2Q9BX68 163 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR61Q9BZJ8 451 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIGMQ9H3S5 423 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF385DQ9H6B1 395 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC25A22Q9H936 323 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMOXQ9NWM0 555 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS28Q9UK41 221 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR52A1Q9UKL2 312 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PADI1Q9ULC6 663 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBC1D24Q9ULP9 559 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIF20BQ96Q89 1820 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEPDC5O75140 1603 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-4.41□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAV10A0A0B4J240 114 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PRB8 838 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLPSL1A2RUU4 121 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GOLGA6CA6NDK9 693 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MSGN1A6NI15 193 aa-4.41□□□□□ -3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms