RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 A0A096LNT2 108 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ARRDC5A6NEK1 342 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RER1O15258 196 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SGCEO43556 437 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TIPRLO75663 272 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TFP02787 698 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GSTM3P21266 225 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LSM6P62312 80 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SCRN3Q0VDG4 424 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 KCNMB1Q16558 191 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ALKBH6Q3KRA9 238 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SLC36A3Q495N2 470 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM255AQ5JRV8 349 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA46Q5T0L3 261 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC2AQ6UVW9 174 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CD300LDQ6UXZ3 194 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB46Q86UZ6 589 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LNX2Q8N448 690 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 IQCF1Q8N6M8 205 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SLC37A3Q8NCC5 494 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 OR1J1Q8NGS3 322 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZNRF4Q8WWF5 429 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SLC7A6Q92536 515 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 BCL2L14Q9BZR8 327 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PLEK2Q9NYT0 353 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 REV1Q9UBZ9 1251 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DUSP13Q9UII6 198 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 POLR1DQ9Y2S0 133 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FKBP7Q9Y680 259 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LHFPL6Q9Y693 200 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CR1P17927 2039 aa12.81□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZFHX3Q15911 3703 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SYNGR3O43761 229 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 E2F6O75461 281 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LY6G6DO95868 133 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 NGFP01138 241 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF250P15622 560 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PRKACGP22612 351 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PYCR1P32322 319 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RAD52P43351 418 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HTR5AP47898 357 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 EVX1P49640 407 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP1-1Q07627 177 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CCNIQ14094 377 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CORO6Q6QEF8 472 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LYPD4Q6UWN0 246 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC9AQ6UXN8 241 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SLC26A10Q8NG04 563 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 OR2T33Q8NG76 320 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 C10orf105Q8TEF2 133 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FAM168AQ92567 244 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RHNO1Q9BSD3 238 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 WACQ9BTA9 647 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 YY1AP1Q9H869 796 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 NTN4Q9HB63 628 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TAAR3PQ9P1P4 343 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJB9Q9UBS3 223 aa12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PPW3 197 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 OR6C6A6NF89 314 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 M0R233 179 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 COX5BP10606 129 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PSKH1P11801 424 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MPV17P39210 176 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GLO1Q04760 184 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 COX10Q12887 443 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CRMP1Q14194 572 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf146Q5VVC0 180 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ASRGL1Q7L266 308 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00346Q8IVM7 164 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 OR51L1Q8NGJ5 315 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD4Q8TB40 342 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SYNPRQ8TBG9 265 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A40Q8TBP6 338 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 C4orf45Q96LM5 186 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RAB1BQ9H0U4 201 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 POFUT1Q9H488 388 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CSPG4Q6UVK1 2322 aa12.79□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TVP23AA6NH52 213 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 H3BN98 237 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ICMTO60725 284 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 NCR1O76036 304 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GYPBP06028 91 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HEXAP06865 529 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DBHP09172 617 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CLUP10909 449 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 NAT2P11245 290 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RPS27P42677 84 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PDLIM4P50479 330 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms