RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 C3orf49Q96BT1 292 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 LRFN5Q96NI6 719 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 PRSS38A1L453 326 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 C5orf51A6NDU8 294 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 CD2P06729 351 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TACSTD2P09758 323 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 CMPK1P30085 196 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SKP1P63208 163 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 IL13RA1P78552 427 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TMPPEQ6ZT21 453 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 NRROSQ86YC3 692 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 MITD1Q8WV92 249 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 PHB2Q99623 299 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ALG12Q9BV10 488 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR2S2Q9NQN1 319 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TREM2Q9NZC2 230 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PPH5 198 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 C9orf170A2RU37 121 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 GPR37O15354 613 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 PPIHO43447 177 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 VAMP1P23763 118 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ADH6P28332 368 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 RAB2AP61019 212 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 RAB11BQ15907 218 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 LINC01590Q5TEZ4 76 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 CD163Q86VB7 1156 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR4S1Q8NGB4 309 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR1E3Q8WZA6 343 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SLC39A7Q92504 469 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TSSK2Q96PF2 358 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 CACFD1Q9UGQ2 172 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 IKZF2Q9UKS7 526 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 DNAJB6O75190 326 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ACKR3P25106 362 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR2B8PP59922 312 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SHHQ15465 462 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 KLHL26Q53HC5 615 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF425Q6IV72 752 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR4C45A6NMZ5 311 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 AP4M1O00189 453 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 NME2P22392 152 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 LPAR6P43657 344 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TFF2Q03403 129 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ELOCQ15369 112 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TMEFF1Q8IYR6 380 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 OR2M4Q96R27 311 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TMED7Q9Y3B3 224 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GV90 55 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 MSGN1A6NI15 193 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 P2RX6O15547 441 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 GLCEO94923 617 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 HOXB2P14652 356 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 NTSR1P30989 418 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 PPICP45877 212 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ID2Q02363 134 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF124Q15973 351 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 MTSS1LQ765P7 747 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ZNF426Q9BUY5 554 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 ASH2LQ9UBL3 628 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-201ENST00000353258 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 PRR19A6NJB7 356 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 NPIPB9F8W1W9 429 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ABHD16AO95870 558 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 CD5P06127 495 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 RAB5AP20339 215 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 LAP3P28838 519 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 CD1CP29017 333 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ACTR1BP42025 376 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 HTR5AP47898 357 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ELOA3BQ3SY89 546 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 COX18Q8N8Q8 333 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 ELOA3Q8NG57 546 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR10G6Q8NH81 332 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms