RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SYT14P1Q58G82 188 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 FGF14Q92915 247 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRM-201ENST00000332175 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 C4AP0C0L4 1744 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRM-201ENST00000332175 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 LIPNQ5VXI9 398 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRM-201ENST00000332175 FCMRO60667 390 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 ECI1P42126 302 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 RHOUQ7L0Q8 258 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 MITD1Q8WV92 249 aa20.38■□□□□ 0.85
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