RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 VSTM5A8MXK1 200 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 APEX1P27695 318 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 HIST1H3AP68431 136 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 GALK2Q01415 458 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC36Q1X8D7 754 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL12Q53G59 568 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 TEX30Q5JUR7 227 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 LPCAT4Q643R3 524 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF774Q6NX45 483 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 HIST2H3AQ71DI3 136 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF511Q8NB15 262 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 NEUROG1Q92886 237 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 CDH20Q9HBT6 801 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 PLEK2Q9NYT0 353 aa23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 E7EQL1 145 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 SNAP29O95721 258 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 GSTT1P30711 240 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 GGT2P36268 569 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ENTPD1P49961 510 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 GDI2P50395 445 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 SLC34A1Q06495 639 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 OTPQ5XKR4 325 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 GALNT4Q8N4A0 578 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 NUP37Q8NFH4 326 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 OR8J1Q8NGP2 316 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 DHRS9Q9BPW9 319 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 MARCH7Q9H992 704 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 FAIMQ9NVQ4 179 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa23.17■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 E9PQ18 207 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 RER1O15258 196 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 DOK2O60496 412 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 SLC2A5P22732 501 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 NR4A1P22736 598 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 HGFACQ04756 655 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 PCK2Q16822 640 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 SLC18B1Q6NT16 456 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF544Q6NX49 715 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 POM121L2Q96KW2 1035 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 IL4I1Q96RQ9 567 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 MBOAT4Q96T53 435 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 WDR76Q9H967 626 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ATPIF1Q9UII2 106 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 NOTCH2Q04721 2471 aa23.16■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 PEX2P28328 305 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 PCSK6P29122 969 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 RPS7P62081 194 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 APOFQ13790 326 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 RAB35Q15286 201 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 NXNL2Q5VZ03 156 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 CORO6Q6QEF8 472 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 PAMR1Q6UXH9 720 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 BBS1Q8NFJ9 593 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 INTS14Q96SY0 518 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 TEAD3Q99594 435 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 LIME1Q9H400 295 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 IMPAD1Q9NX62 359 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 LOC100509620A0A075B734 347 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 C5orf49A4QMS7 147 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 SYNGR3O43761 229 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 RAF1P04049 648 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 CCL2P13500 99 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 CCNOP22674 350 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 RAD52P43351 418 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 KEAP1Q14145 624 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ELFN2Q5R3F8 820 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 LCN1P1Q5VSP4 162 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 LYPD4Q6UWN0 246 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 SHFQ7M4L6 423 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 LINC00346Q8IVM7 164 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 OR1F12Q8NHA8 337 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 NRGNQ92686 78 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 HDHD2Q9H0R4 259 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 FAM118AQ9NWS6 357 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 GMPPBQ9Y5P6 360 aa23.14■■□□□ 1.3
CRIP1-201ENST00000330233 HTR5AP47898 357 aa23.13■■□□□ 1.29
CRIP1-201ENST00000330233 FABP6P51161 128 aa23.13■■□□□ 1.29
CRIP1-201ENST00000330233 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CRIP1-201ENST00000330233 ECH1Q13011 328 aa23.13■■□□□ 1.29
CRIP1-201ENST00000330233 AADACL4Q5VUY2 407 aa23.13■■□□□ 1.29
CRIP1-201ENST00000330233 ARL9Q6T311 187 aa23.13■■□□□ 1.29
CRIP1-201ENST00000330233 B3GLCTQ6Y288 498 aa23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms