RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 POTEKPQ9BYX7 375 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 PRRG4Q9BZD6 226 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ETAA1Q9NY74 926 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 STMN3Q9NZ72 180 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 KALRNO60229 2985 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 A0A0J9YW62 118 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TEX46H3BTG2 121 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CCNKO75909 580 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 EDN3P14138 238 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 LIFP15018 202 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 GALP22466 123 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 SRP9P49458 86 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 HSF2Q03933 536 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 PLA2G7Q13093 441 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 SLC17A1Q14916 467 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CCDC58Q4VC31 144 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 C3P1Q6ZMU1 363 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 DEFB124Q8NES8 71 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 EMC7Q9NPA0 242 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 LMX1BO60663 402 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 GAAP10253 952 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 NTF4P34130 210 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 DLX5P56178 289 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ZP4Q12836 540 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 PLET1Q6UQ28 207 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 KRT77Q7Z794 578 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 SCAIQ8N9R8 606 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 OR8B4Q96RC9 309 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 LRP12Q9Y561 859 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ISPDA4D126 451 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 FAM166BA8MTA8 275 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TNFSF11O14788 317 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TACSTD2P09758 323 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ZNF823P16415 610 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CD53P19397 219 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 PPP3R1P63098 170 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 XKRXQ6PP77 449 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 RNF170Q96K19 258 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 GPER1Q99527 375 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 NDEL1Q9GZM8 345 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ZNF222Q9UK12 451 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.04□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 WDPCPO95876 746 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 IGHMP01871 453 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ZNF43P17038 809 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CRABP1P29762 137 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 SPOCK1Q08629 439 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 UEVLDQ8IX04 471 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ST7LQ8TDW4 575 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 MIB2Q96AX9 1013 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 C4orf45Q96LM5 186 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 SOX7Q9BT81 388 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CCDC32Q9BV29 185 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 SPATA2Q9UM82 520 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 KMT2EQ8IZD2 1858 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 NOTOA8MTQ0 251 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 FZD7O75084 574 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 ARL6IP5O75915 188 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CELA3AP09093 270 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 PTGS2P35354 604 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CD96P40200 585 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CLDN15P56746 228 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 CLDN17P56750 224 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 SELENBP1Q13228 472 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.03□□□□□ -1.6
USP15-201ENST00000280377 TMEM164Q5U3C3 297 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms