RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 TINAGQ9UJW2 476 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PR64 198 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PRV1 198 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 WRBO00258 174 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 LDB3O75112 727 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFB2O95178 105 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ADRA2CP18825 462 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 RAB6AP20340 208 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 BCL6P41182 706 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 PNLIPRP2P54317 469 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 OR1D5P58170 312 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ACTBP60709 375 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ACTG1P63261 375 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 OR51A4Q8NGJ6 313 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 KLF15Q9UIH9 416 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1B0GWA3 101 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM235A6NFC5 223 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 A6NLC8 198 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 C4orf47A7E2U8 309 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 KLF4O43474 513 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 CALCBP10092 127 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 TAS2R19P59542 299 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 IL10RAQ13651 578 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ALG11Q2TAA5 492 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ACER2Q5QJU3 275 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM64Q6YI46 380 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 GATSQ8NAP1 163 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 FAM46BQ96A09 425 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 TGIF2Q9GZN2 237 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.81□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 A0A0A6YYD5 115 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 F10P00742 488 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 SFTA3P0C7M3 94 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF136P52737 540 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 F2RL1P55085 397 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 REEP5Q00765 189 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 CCINQ13939 588 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 RAB11BQ15907 218 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 SSX9Q7RTT3 188 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 SYS1Q8N2H4 156 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ACBD4Q8NC06 268 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 OR5K2Q8NHB8 316 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 SFXN5Q8TD22 340 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ALG12Q9BV10 488 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 PELI2Q9HAT8 420 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PPE3 182 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 CLEC3AO75596 197 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ABOP16442 354 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ADH6P28332 368 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 GPR18Q14330 331 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 LY6G6FQ5SQ64 297 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 OR2L2Q8NH16 312 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 PHB2Q99623 299 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 RGCCQ9H4X1 137 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 LRIT1Q9P2V4 623 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 CTAG2O75638 210 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 CEACAM5P06731 702 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 DCST2Q5T1A1 773 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.8□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms