RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270645.7

RCN3-201, Transcript of reticulocalbin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCN3, Length 1,859 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3-201ENST00000270645 FBXL3Q9UKT7 428 aa18.27■□□□□ 0.52
RCN3-201ENST00000270645 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
RCN3-201ENST00000270645 WT1P19544 449 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 APEX1P27695 318 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 SOX2P48431 317 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 TPTEP56180 551 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 C10orf128Q5T292 105 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 AKAP14Q86UN6 197 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 TMEM251Q8N6I4 163 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 HAS2Q92819 552 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 PPP1R14AQ96A00 147 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 SLAMF6Q96DU3 332 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 C1orf198Q9H425 327 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 CENPMQ9NSP4 180 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 NPAP1Q9NZP6 1156 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 MED13Q9UHV7 2174 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ADAM30Q9UKF2 790 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 TBC1D24Q9ULP9 559 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 LHFPL6Q9Y693 200 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 FAM166BA8MTA8 275 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 PDCD5O14737 125 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 RAF1P04049 648 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 H2BFMP0C1H6 154 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ATF1P18846 271 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 MAGEA5P43359 124 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 NHLH1Q02575 133 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ODF4Q2M2E3 257 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 HYAL4Q2M3T9 481 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 OR51A4Q8NGJ6 313 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 OR10S1Q8NGN2 331 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ROBO4Q8WZ75 1007 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 GFI1Q99684 422 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 C14orf119Q9NWQ9 140 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.26■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ZNF716A6NP11 495 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 CD46P15529 392 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 SELENOPP49908 381 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 MEOX1P50221 254 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 PLGLB1Q02325 96 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 CAMK2BQ13554 666 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 RTP5Q14D33 572 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 C20orf196Q8IYI0 205 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 OR8H2Q8N162 312 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 GDPD1Q8N9F7 314 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 SLC25A18Q9H1K4 315 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 TIGARQ9NQ88 270 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa18.25■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ANKRD61A6NGH8 418 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 PAHP00439 452 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ELK1P19419 428 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 LHX2P50458 406 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 BAK1Q16611 211 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 PDSS1Q5T2R2 415 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 CFAP77Q6ZQR2 320 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 PNPLA2Q96AD5 504 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 G6PC2Q9NQR9 355 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ABRACLQ9P1F3 81 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 EMC9Q9Y3B6 208 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 DLL1O00548 723 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.514e-6■□□□□ 10.2
RCN3-201ENST00000270645 DCTDP32321 178 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 STAC2Q6ZMT1 411 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 THRSPQ92748 146 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 SCMH1Q96GD3 660 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 TCF7L1Q9HCS4 588 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 CYSLTR2Q9NS75 346 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 OR52A1Q9UKL2 312 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 POLR1DQ9Y2S0 133 aa18.24■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 NTF4P34130 210 aa18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 MMP16P51512 607 aa18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 RHOUQ7L0Q8 258 aa18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 LRRTM1Q86UE6 522 aa18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 TMEM106AQ96A25 262 aa18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
RCN3-201ENST00000270645 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms