RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 B4DXG7 233 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ANHXE9PGG2 379 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 PF4P02776 101 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 SLC35B1P78383 322 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SLC6A19Q695T7 634 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 APOOLQ6UXV4 268 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 FRMD1Q8N878 549 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 RAB18Q9NP72 206 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.14□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 ACOT8O14734 319 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 PCP4P48539 62 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 APOFQ13790 326 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ACTBL2Q562R1 376 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 LCN10Q6JVE6 187 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GRINAQ7Z429 371 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 OR6S1Q8NH40 331 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 AKR1C2P52895 323 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 MOSPD3O75425 235 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 OSMP13725 252 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 AOAHP28039 575 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SNCAP37840 140 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 BTG1P62324 171 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 ANGPTL7O43827 346 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 GLAP06280 429 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP3-201ENST00000268049 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.13□□□□□ -1.27
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