RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 DTD2Q96FN9 168 aa6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ADAM19Q9H013 955 aa6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 PRO1933Q9H354 126 aa6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 PARP11Q9NR21 331 aa6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.53□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.53□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 FITM1A5D6W6 292 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM235A6NFC5 223 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM212A6NML5 194 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TCAPO15273 167 aa6.52□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 PKIAP61925 76 aa6.52□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 LEG1Q6P5S2 330 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.52□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 NRROSQ86YC3 692 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.52□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 MCHR2Q969V1 340 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CASD1Q96PB1 797 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CA14Q9ULX7 337 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.52□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 ZNF563Q8TA94 476 aa6.52□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 TSSK2Q96PF2 358 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 AQP10Q96PS8 301 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.52□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.52□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 CFPP27918 469 aa6.52□□□□□ -1.37
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CSDE1-201ENST00000261443 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 OR2A2Q6IF42 318 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 AMZ2Q86W34 360 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.52□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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