RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LYPD4Q6UWN0 246 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PRSS57Q6UWY2 283 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PARP8Q8N3A8 854 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 OR51L1Q8NGJ5 315 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 OR1J2Q8NGS2 313 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC9Q8WXX5 260 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 DOK1Q99704 481 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 B9A039 149 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 RER1O15258 196 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SYNGR3O43761 229 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-39P01824 125 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 FAM157BP0CG42 384 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 COX5BP10606 129 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PSKH1P11801 424 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ZNF23P17027 643 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CRISP1P54107 249 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 UCP2P55851 309 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ATP5J2P56134 94 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ERVS71-1P61550 626 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 Q5PR19 223 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SHEQ5VZ18 495 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 LRP11Q86VZ4 500 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ZNF101Q8IZC7 436 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SVOPLQ8N434 492 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 MED20Q9H944 212 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CDH20Q9HBT6 801 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A19Q9HC21 320 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 OAZ3Q9UMX2 235 aa19.18■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ACANP16112 2415 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 C5orf49A4QMS7 147 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 H7C417 338 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SURF4O15260 269 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ICMTO60725 284 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 GYPBP06028 91 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SPI1P17947 270 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 EPHA2P29317 976 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 GALK2Q01415 458 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SCRN3Q0VDG4 424 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 LINC01590Q5TEZ4 76 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CORO6Q6QEF8 472 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 OR2T4Q8NH00 348 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CMAHPQ9Y471 501 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SPEF1Q9Y4P9 236 aa19.17■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 MED13LQ71F56 2210 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 OR6C6A6NF89 314 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 FAM183AA6NL82 134 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SGCEO43556 437 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 IFNGP01579 166 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 GDI2P50395 445 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R2BQ00005 443 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SLC18B1Q6NT16 456 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ZFP1Q6P2D0 407 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PROKR2Q8NFJ6 384 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 OR51B6Q9H340 312 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 KIF17Q9P2E2 1029 aa19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 TVP23AA6NH52 213 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 RIIAD1A6NNX1 92 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 DOK2O60496 412 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 NGFP01138 241 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 HMGN1P05114 100 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CCNOP22674 350 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 EVX1P49640 407 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 DNM1P46Q6ZS02 220 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 LURAP1LQ8IV03 231 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 LINC00346Q8IVM7 164 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ZNF511Q8NB15 262 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A6Q92536 515 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 TMUB1Q9BVT8 246 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 WDR76Q9H967 626 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 S100A14Q9HCY8 104 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PLEK2Q9NYT0 353 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 FZR1Q9UM11 496 aa19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SAC3D1A6NKF1 404 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ZNF250P15622 560 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ZNF3P17036 446 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 RPS27P42677 84 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 RAD52P43351 418 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ESRRGP62508 458 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 PCK2Q16822 640 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 TMEM255AQ5JRV8 349 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 CFAP77Q6ZQR2 320 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 GJC3Q8NFK1 279 aa19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms