RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 TO15178 435 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 CLDN17P56750 224 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TTC9Q92623 222 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 H3BNC9 293 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TNFRSF10CO14798 259 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 DOK2O60496 412 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 GSG1Q2KHT4 349 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 Q6ZNB5 142 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 CDCP1Q9H5V8 836 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 V9GYH0 126 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 FGF17O60258 216 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 OPN1LWP04000 364 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 FCGR2CP31995 323 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ARL3P36405 182 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 CASP6P55212 293 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 FAM74A1Q5RGS3 127 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 IL34Q6ZMJ4 242 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 C2orf50Q96LR7 162 aa16.94■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SFRP5Q5T4F7 317 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 NAA40Q86UY6 237 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 GPR32P1Q8NGA4 272 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 C22orf15Q8WYQ4 148 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 BCKDHBP21953 392 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ITGB8P26012 769 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 RPL12P30050 165 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 MPPED2Q15777 294 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 EXD3Q8N9H8 876 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 GJC3Q8NFK1 279 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 LRP5LA4QPB2 252 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SLC17A2O00624 439 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ADRA2CP18825 462 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 EIF1P41567 113 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SLC17A1Q14916 467 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM88Q6PEY1 159 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 IL22RA1Q8N6P7 574 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SLC17A5Q9NRA2 495 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 KCND3Q9UK17 655 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 CD22P20273 847 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 AADACP22760 399 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 C11orf87Q6NUJ2 197 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 OR52B4Q8NGK2 314 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SFT2D1Q8WV19 159 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 C20orf24Q9BUV8 137 aa16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 A0A0A6YYD5 115 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 MSR1P21757 451 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 MSX1P28360 303 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 IL2RGP31785 369 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SCAND1P57086 179 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF77Q15935 545 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 CST9LP1Q5W188 147 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 BRICD5Q6PL45 260 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 OR5M1Q8NGP8 315 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 UHRF2Q96PU4 802 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 INHBBP09529 407 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SKA3Q8IX90 412 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM231Q9H6L2 316 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 FN3KRPQ9HA64 309 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SERTAD4Q9NUC0 356 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 PADI1Q9ULC6 663 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD61A6NGH8 418 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 WNT1P04628 370 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 AGERQ15109 404 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ACKR1Q16570 336 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 TAF9Q16594 264 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 E5RGE8 158 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 CD37P11049 281 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 GPR85P60893 370 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 C19orf57Q0VDD7 668 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF683Q8IZ20 524 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 BCO1Q9HAY6 547 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 NSG2Q9Y328 171 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 GLSO94925 669 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 HMSDA8MTL9 139 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
HOXA13-201ENST00000222753 PSMB3P49720 205 aa16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms