RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068411.4

Ccdc88c-201, Transcript of Protein Daple, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc88c, Length 7,542 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Exosc8Q9D753 276 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tmem201A2A8U2 664 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Gm13271B1AYH9 182 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Prdm13E9PZZ1 754 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ip6k1Q6PD10 433 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tas2r39Q7TQA5 319 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr1500Q7TQQ3 311 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Mitd1Q8VDV8 249 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ripply3Q924S9 152 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fgf21Q9JJN1 210 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Rhox2hK7N6P1 191 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Dusp1P28563 367 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Bex6Q3TZW7 114 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Hes3Q61657 175 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Babam2Q8K3W0 383 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr575Q8VH16 318 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 CtszQ9WUU7 306 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Gm14418A2ARR6 358 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Gm14322A2AW66 358 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 1700003H04RikE9PXM2 192 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Zfp169E9Q3R6 731 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Prr23a1G3UW32 258 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Gpr160Q3U3F9 336 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Vmn1r201Q8R262 300 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Zfp758E9QAA1 583 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 P04213 122 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 TrmoQ562D6 431 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 InavaQ7TN12 663 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Katnb1Q8BG40 658 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Rab38Q8QZZ8 211 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Bcl7bQ921K9 202 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Sucnr1Q99MT6 317 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Rpl22l1Q9D7S7 122 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 PolmQ9JIW4 496 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Gm17669F6QL70 154 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 GbaP17439 515 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 LhcgrP30730 700 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ly6dP35459 127 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 P58686 83 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Bcl2a1cQ0P538 128 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Adprhl1Q8BGK2 353 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Cbr3Q8K354 277 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr732Q8VFT5 308 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Vmn1r43Q8VIC9 329 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Cdca5Q9CPY3 264 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Emc6Q9CQW0 110 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 CmipQ9D486 773 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Slc35a2Q9R0M8 390 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Gm5901D3YVJ1 333 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Vmn2r80E9Q1L0 863 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Cuzd1P70412 606 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr141Q60880 325 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Acp6Q8BP40 418 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 CmblQ8R1G2 245 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Il34Q8R1R4 235 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr1241Q8VF91 314 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Abcg5Q99PE8 652 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Hhipl2Q9D2G9 717 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 AplfQ9D842 499 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Decr2Q9WV68 292 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr1006A2ALD2 312 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ifna7P06799 190 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 EngQ63961 653 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tmem184bQ8BG09 407 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Vmn1r226Q8R2A8 298 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr1394Q8VET2 312 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 CalyQ9DCA7 226 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr243E9PV96 316 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr628K7N6B2 316 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Hoxd12P23812 268 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Irs1P35569 1233 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Dgcr2P98154 548 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tmem38aQ3TMP8 298 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fbxw18Q3TSA9 469 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 March9Q3TZ87 348 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Acsm4Q80W40 580 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Zfp799Q8BHK4 648 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 NraddQ8CJ26 228 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Letmd1Q924L1 360 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Rhox2aQ9D4Y3 191 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Lgi1Q9JIA1 557 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Vmn2r108E9PYS0 855 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 P01810 119 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Dvl1P51141 695 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 MakQ04859 622 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Olfr733Q14AK5 308 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Bahd1Q497V6 772 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Mea1Q64327 174 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 D2hgdhQ8CIM3 535 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fgf22Q9ESS2 162 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ntn4Q9JI33 628 aa11.62□□□□□ -0.55
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 IfnabL7MTU6 190 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms