RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rfpl4aQ8VH31 287 aa11.47□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acy3Q91XE4 318 aa11.47□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D730048I06RikQ9CQB8 106 aa11.47□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med31Q9CXU1 131 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Derl3Q9D8K3 228 aa11.47□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp18Q9WTV6 368 aa11.47□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il18bpQ9Z0M9 193 aa11.47□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pkd1l3Q2EG98 2201 aa11.47□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TprF6ZDS4 2431 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spaca5A2AE20 160 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AI182371A2AS37 356 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lao1B1ARV3 523 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Colca2F8VPY8 239 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw15L7N1X6 466 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klri2Q5DT36 248 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RalyQ64012 312 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sp9Q64HY3 484 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Man1c1Q6NXK9 625 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl6Q6V595 619 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sez6Q7TSK2 991 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudt15Q8BG93 170 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem150cQ8C8S3 249 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eipr1Q8K0G5 386 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndc1Q8VCB1 673 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr518Q8VEW1 333 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1151Q8VFQ8 308 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrgpra1Q91WW5 304 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nkain1Q9D035 207 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Twsg1Q9EP52 222 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Isyna1Q9JHU9 557 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxo1Q9R1E0 652 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem176bQ9R1Q6 263 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asah1Q9WV54 394 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dock10Q8BZN6 2150 aa11.46□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1432A0A140LHS7 346 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp345A2AQA1 561 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930595D18RikD3Z642 64 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cops3O88543 423 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camk2aP11798 478 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pax4P32115 349 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc2P59267 366 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2mP61082 183 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Six5P70178 719 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex52Q3TTI8 308 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ScimpQ3UU41 150 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gal3st4Q3V1B8 480 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnase12Q5GAM8 145 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 St8sia1Q64687 355 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1463Q7TQR3 310 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr198Q7TS40 306 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgat4aQ812G0 535 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr92Q8BGF3 357 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gfm1Q8K0D5 751 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctxn1Q8K129 82 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AspnQ99MQ4 373 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lap3Q9CPY7 519 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Obp1aQ9D3H2 163 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Six6Q9QZ28 246 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AireQ9Z0E3 552 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apc2Q9Z1K7 2274 aa11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SpenQ62504 3644 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm15446D3Z5Y8 553 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21797J3QNW5 180 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtsaP16675 474 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpp4P28843 760 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a1P31648 599 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec10aP49300 304 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P58686 83 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srsf6Q3TWW8 339 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ArsgQ3TYD4 525 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw16Q497Z0 464 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspb6Q5EBG6 162 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2610318N02RikQ80VT5 305 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam30Q811Q3 732 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam221aQ8C790 301 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NraddQ8CJ26 228 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 St8sia6Q8K4T1 398 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Duoxa1Q8VE49 341 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr734Q8VFT4 313 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr651Q8VG78 313 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3galnt1Q920V1 331 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pink1Q99MQ3 580 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3gat1Q9CW73 334 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cers4Q9D6J1 393 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D8N1 392 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TfecQ9WTW4 317 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eci2Q9WUR2 391 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a43A2A3V2 341 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20489A2AGH5 449 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem229aB9EJI9 371 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OpcmlG5E8G3 345 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcns1O35173 497 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pou2f1P25425 770 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klf16P58334 251 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lcn12Q6JVL5 193 aa11.45□□□□□ -0.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eci3Q78JN3 317 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.9 ms